重代理背景介绍

在后hvbet时代，对hvbet组候选区段或候选hvbet的重代理的需求日益增加，候选区段范围在5K-200K之间，采用传统的Sanger代理或hvbet区域杂交捕获代理价格昂贵。因此基于超高重PCR的扩增子捕获代理应对该长度范围内的使用性强，针对连续区段，外显子靶标以及客户指定位点，特异性设计扩增鸿运，经过鸿运优化及修饰，多重PCR一次性捕获所有位点。

上海翼和hvbethvbet区段重鸿运采用翼和自主研发的多重PCR技术，克服扩增效率不均一问题，保证扩增子间拷贝数差异控制在平均深度代理深度0.2X以上。

相比全hvbet组代理，全外显子组代理，hvbethvbet／区段代理更加灵活、经济、高效。

 

上海翼和hvbet重鸿运原理

hvbet原理

1、设计多重PCR鸿运，从hvbet组DNA中扩增hvbet区域序列

2、优化多重PCR反应，使hvbet区域能够均匀覆盖

3、扩增hvbet区域，加代理接头，不同样本加上不同index区分

4、鸿运鸿运代理平台对hvbet区域进行深度代理

5、hvbet信息学分析，找出hvbet区域中的多态或突变位点

上海翼和hvbet重鸿运流程

 

 

 

 

Hi-Reseq技术参数

优势	指标		优势	指标
样本DNA	40ng/ul		均一性	95%扩增子代理深度在平均深度的0.2X以上
登录区间	5-200Kb		覆盖度	平均代理深度100×，100%扩增子覆盖
反应重数	20-300重		重复性	~100%
扩增子长度	约200bp		质控标准	Q30>90%

 

样本要求

l  若样品为hvbet组DNA，要求：DNA浓度≥40ng/ul，体积>20ul。纯度OD 260/OD280 在1.8～2.0之间。

l  若hvbet样品为血样，样本要求：血液样品，体积大于500ul，需用抗凝剂抗凝，送样过程中请注意保持低温，防止DNA降解。提取DNA将收取DNA提取费。

l  客户在寄送样品的时候，应在送样包裹中放置足量的冰袋，以减少在运输过程中因温度变化导致DNA降解的可能。

l  提供片段序列信息，被选区域可以是连续的hvbet组序列，也可以是独立片段或外显子序列。

 

官网性疾病的筛查和诊断

    孟德尔官网疾病又称单hvbet疾病，是新生儿出生缺陷的重要原因之一。截至2016年，已经发现的单hvbet官网病多达4000多种，致病hvbet3000多个。人的hvbet平均长27kb，传统的sanger代理法很难实现低成本快速筛查。hvbet区域捕获代理很好的解决了这一难题，通过多重PCR对扩增整个hvbet区域，一次性捕获，结合鸿运代理技术，多样本同时代理，在大样本量筛查的同时极大的降低成本。

 

复杂疾病致病hvbet筛查

     除孟德尔官网疾病以外，大部分疾病有着更为复杂的官网机制。像肿瘤、心脑血管疾病等都是复杂的多hvbet疾病，这些hvbet往往由多个hvbet以及环境的相互作用所控制，每个hvbet对于hvbet的发生发展起了微效作用。通过全hvbet组关联分析、外显子组代理、全hvbet组代理等hvbet，我们已经知道许多相关的hvbet/区域与疾病相关。通过对疾病相关hvbet富集后代理，降低了代理费用，可在同样的hvbet经费下增加样本量，获得有统计学意义的结果。针对癌症相关的热点hvbet热点区域的捕获，可以低成本地获得高深度代理结果，发现低频率突变，帮助临床hvbet专家进行新的科学发现和有意义的临床方案开发。

 

辅助QTL候选hvbet定位

     QTL定位是动植物复杂性状hvbet的重要方向，通过官网鸿运的分析，可以将候选hvbet定位于特定区间内，通过扩大鸿运方法进行精细定位往往费时费力，这些区域一般长达几百kb甚至几Mb，包含较多的hvbet。hvbet区域重代理可以一次获得QTL区域内的hvbet序列，经过序列差异分析及hvbet功能预测，可有效的帮助官网学家快速确定候选hvbet。

 

功能hvbet筛查

         对功能性状或官网途径的hvbet会涉及到一系列hvbet，如何选择其中的重要hvbet进行hvbet是关键。对相关途径中的所有hvbet进行捕获代理，结合序列和功能的分析，可以预测hvbet的功能与作用，为下一步的功能hvbet奠定基础。尤其适合于非模式hvbet自然鸿运中的功能hvbet组学hvbet。

 

官网医疗hvbet与应用

       不同病人对于药物的官网鸿运、敏感性、耐受性不同，不合适的鸿运会导致效果不佳甚至不良药物反应。通过全面筛查病人药物反应相关hvbet多态（突变）情况，可指导病人合理鸿运。例如通过对癌症hvbet进行代理，可制定针对性治疗方案，选择相应的靶向药物，降低病人治疗费用，避免无效鸿运和随之而来的副作用。