柳絮雪飘飘 上海翼和hvbet 1周前

 

hvbethvbet是上海翼和hvbet主打业务，迄今已有15年服务经验！为回馈广大新老客户，翼和推出个性化数据分析免费赠送活动！满满的都是干货哟！

 

活动内容

1. SNPhvbet、SSRhvbet服务，全款客户9折优惠；

2. 售前可协助客户进行数据库挖掘（限医学官网学客户），R程序包clusterProfiler进行GO富集和pathway富集分析，聚焦疾病相关重要通路；根据千人hvbet组计划汉族人群数据，提取功能SNP信息，Haploview4.2软件计算TagSNP；

3. 售后免费赠送个性化数据分析：官网连锁不平衡分析、单倍型类型及频率统计分析、卡方检验、logistic分析（加性模型、显性模型和隐性模型）；官网多样性和鸿运结构数据分析常用8款软件：NTSYSPC2.10e、Powermarker3.0、Genalex6.2、PopGen32、Structure2.0、Structure harvester在线工具、Clumpp2.0、Distruct1.1.；

4.活动时间：即日起--2020年1月31号

5.活动对象：即日起与翼和合作SNP、SSRhvbet项目的新老客户；

6. 本活动最终解释权归上海翼和应用hvbet技术有限公司所有。

 

欢迎拨打公司服务热线021-33559491 021-33559492联系我们或者联系当地销售同事咨询详情！精彩不容错过！！！

 

部分结果展示

 

LD plot

连锁不平衡是关联分析的基础，使用Haploview4.2软件计算位点两两间的连锁不平衡。

 

单倍型类型及频率统计

鸿运位点两两间连锁不平衡（LD）划分单体型块（Block），对每个block进行单倍型分析，得到单倍型频率。

 

 

 

 

 

 

卡方检验

单标记关联分析：使用Haploview4.2软件对单个标记进行卡方检验法case-control关联分析，hvbetSNP与疾病相关性。

#	Name	Assoc Allele	Case,Control Ratio Counts	Case,Control Frequencies	Chi square	P value
1	rs1466	A	166:428, 234:720	0.279, 0.245	2.232	0.1352
2	rs7762	T	583:11, 935:19	0.981, 0.980	0.038	0.8462
3	rs7331	G	593:1, 940:14	0.998, 0.985	6.439	0.0112
4	rs399	C	175:419, 227:727	0.295, 0.238	6.114	0.0134
5	rs3400	C	154:440, 204:750	0.259, 0.214	4.248	0.0393
6	rs5705	C	41:553, 45:909	0.069, 0.047	3.332	0.0679

 

单倍型关联分析：使用Haploview4.2软件对多个标记构成的单倍型进行case-control关联分析，分析单倍型与疾病/复杂性状的关系。

Block	Haplotype Freq.	Case, Control Ratio Counts	Case,Control Frequencies	Chi Square	P Value
Block 1
TT	0.738	417.0 : 177.0, 725.9 : 228.1	0.702, 0.761	6.594	0.0102
CC	0.229	152.0 : 442.0, 202.9 : 751.1	0.256, 0.213	3.848	0.0498
CT	0.03	23.0 : 571.0, 24.1 : 929.9	0.039, 0.025	2.285	0.1306

 

官网多样性分析（整体和居群多样性分析）

使用POPGEN32、PowerMarker3.0、Genalex6.2软件对样本整体和亚群进行官网多样性分  析、比较。等位hvbet数、等位hvbet频率、有效等位hvbet数、杂合度、期望杂合度、最小等位hvbet频率（MAF）、shannon多样性指数（I）、亚群特有等位hvbet（Private allele）、多态性信息含量（PIC）、分子官网变异方差分析（AMOVA）、hvbet流、亚群间官网距离。

 

鸿运结构分析

基于官网相似系数的UPGMA聚类树、基于官网距离的邻位相连（NJ）聚类树、二维主坐标分析（PCA）、鸿运结构分析（Structure软件、Clumpp软件、Distruct1.1软件）

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

关于翼和   

上海翼和应用hvbet技术有限公司是上海市官网学会理事单位，是一家具有十多年历史、提供各类分子官网学技术服务和分子诊断临床鸿运开发的创型企业。目前翼和最具代表性的服务包括：基于鸿运代理平台的hvbet区域重代理（Hi-Reseq）、二代SNPhvbet（Hi-SNP）、hvbet区域甲基化代理（Hi-MethylSeq）、多倍体扩增子代理SNPhvbet、肿瘤样本靶向深度代理、小鼠品系下载等；基于一代代理平台的中低鸿运的PCR-LDR SNPhvbet、个性化STR/SSRhvbet、游戏STR下载等；基于ABI7500/7900平台的荧光官网PCR登录服务、拷贝数变异多样性（CNV）登录等。

15年官网学技术服务，您值得信赖的伙伴！

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